汽车变速箱进水后的维修步骤如下：
轻度进水：通过拆解观察变速箱里面的螺丝，如果发现有部分螺丝生锈，则可以判断是变速箱轻度进水。为了延长使用寿命，避免变速箱大修，尽量及时前往4S店等专业维修机构，更换胶圈、油封和摩擦片等部件，并建议更换变速箱油和差速油。
中度进水：当变速箱内部油底壳出现白色沉淀物时，说明此时已经中度进水，需要前往专业维修点处理，胶圈、油封、摩擦片以及变速箱油和差速油都须更换。
严重进水：根据放油直接观察，当变速箱严重进水时，要到4S店等专业维修机构更换胶圈、摩擦片、变速箱油和差速油、链轮、变速箱阀体以及自动挡多功能开关。
水中含有泥沙等杂质：当变速箱中进了脏水或有泥沙的水后又行驶或又运转了，因为运转和行驶水在变速箱内与油高速搅动，油与水就乳化了，油与水是很难分开，这就要在维修点把变速箱拆下来打开清洗，如泥沙进入到轴承，特别是一轴轴承，那就要把变速箱内所有部件拆下清洗。